阴茎的皮肤比其他部位皮肤黑是正常的生理现象，因为男性的生长发育以及第二性征的出现，毛发浓密的区域色素沉着会加快，生殖器附近的皮肤表现更为明显。阴茎附近的皮肤颜色会随自身各器官发育而变深，是因为随着年龄的增长与自身性器官逐步成熟导致体内雄性激素分泌旺盛，同时第二性征也会出现，比如出现胡子、喉结。
刚从母体分娩出来时身体各部位皮肤颜色基本一致，不会有太大色差，发育的同时体内的黑色素也会有选择性沉着，会在毛发较为旺盛的区域聚集使其颜色加深，多在阴茎、阴囊等附近，也有部分人肛门周围也会有颜色变深的趋势。